Best,возбудители бактериальных инфекций (тот же колумнарис, или какой-нить микобактериоз) - они всегда есть в наличие, они есть в рыбах, в воде. Однако, в активную стадию они переходят только тогда, когда обваливается иммунитет рыбы по какой-либо причине (как правило - хреновое качество воды, кормежки и пр., а также - на фоне других заболеваний - паразиты, гельминты и т.п., которые сильно подрывают иммунитет). Лечить бактериалку - очень сложно. При благоприятном раскладе рыбу удается вытянуть, но ценой потери биологического равновесия среды - растениям и биофильтрации писец. И это благоприятный исход. Неблагоприятный - все умерли и всё подохло. Действия строго как при эпидемии - малейший симптом - отсадка пациента в отдельную посудину карантинного типа (без всяких растений и грунтов, с хорошей водой, аэрацией) и там пробовать уже лечить, хотя бы с целью выяснить на какой препарат и как реагирует болячка. Попутно - пристально наблюдать за остальными рыбками. Надо сказать, что лечение бактериалки - крайне хлопотное и утомительное занятие с невысокой вероятностью благоприятного исхода. Проще не допускать.
Если все же получили мегавспышку заболевания и после попыток лечить все закончилось унитазированием обитателей аквариума, то для нового запуска надо конечно все дезинфицировать. Грунт промыть и прокалить в духовке (или обработать хлорсодержащим чем-нить, типа "Белизны"). Фильтры и всякие причиндалы - сачки, трубочки и пр. - подвергнуть тотальной свирепой дезинфекции.